52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0999 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
674 aa  1370    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  38.12 
 
 
729 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
732 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 
734 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  39.02 
 
 
728 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  39.18 
 
 
728 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  35.99 
 
 
729 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 
731 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  36.19 
 
 
695 aa  422  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 
759 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  30.04 
 
 
726 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  30.18 
 
 
726 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  36.99 
 
 
829 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  37.9 
 
 
1042 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
726 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 
722 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  35.99 
 
 
744 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
744 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  35.54 
 
 
747 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  34.19 
 
 
749 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.19 
 
 
749 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 
582 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  33.33 
 
 
743 aa  349  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  33.99 
 
 
580 aa  347  6e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
575 aa  346  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  33.95 
 
 
577 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  34.14 
 
 
551 aa  339  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 
566 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  34.38 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  34.38 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  34.44 
 
 
566 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
584 aa  317  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
580 aa  316  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  31.61 
 
 
574 aa  313  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
1162 aa  300  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
1006 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
1022 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 
1000 aa  228  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
994 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  23.67 
 
 
902 aa  91.3  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
609 aa  73.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
1187 aa  67.8  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
606 aa  67.4  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 
485 aa  50.4  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  21.21 
 
 
484 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  24.01 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 
485 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  21.24 
 
 
812 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 
472 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  22.11 
 
 
817 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 
528 aa  44.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>