More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0980 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 360 aa  727    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  63.31 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  58.05 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  56.9 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  59.43 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  58.08 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.31 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.74 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.69 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.75 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  62.07 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.75 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  51.81 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  52.59 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  56.79 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  52.2 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  55.73 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>