91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0972 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0972  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 114 aa  214  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.68709e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0879  ATP synthase F0, C subunit  65.06 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  44.76 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  47.25 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  50.79 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  43.84 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  41.46 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  45.33 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  40.79 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  40.79 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  40.79 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  37.18 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  52.24 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  35.96 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  48.98 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  48.98 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  42.65 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  44.23 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  35.06 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  34.48 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.94 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  38.2 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  35.37 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  36.25 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  36.25 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.78 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  30 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  30.23 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  36 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  31.67 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  32.35 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  30 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  29.41 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3735  F0F1 ATP synthase subunit C  39.02 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246424  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  30 
 
 		 93 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  31.03 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  39.19 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  40.3 
 
 		 100 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  42.5 
 
 		 72 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 77 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  35.19 
 
 		 82 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2387  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 72 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>