More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0964 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 804 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.69 
 
 		 804 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  51.29 
 
 		 795 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  44.88 
 
 		 806 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  46.37 
 
 		 812 aa  686    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  46.48 
 
 		 769 aa  685    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  48.95 
 
 		 804 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  42.39 
 
 		 795 aa  636    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  44.88 
 
 		 842 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  47.08 
 
 		 805 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46.8 
 
 		 814 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  46.35 
 
 		 769 aa  683    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.4 
 
 		 884 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  0.0000000317646 
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  44.46 
 
 		 810 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  46.88 
 
 		 805 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  45.07 
 
 		 805 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  44.61 
 
 		 809 aa  666    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  47.01 
 
 		 805 aa  678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.33 
 
 		 805 aa  689    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.45 
 
 		 805 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  45.07 
 
 		 805 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  44.4 
 
 		 809 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  46.27 
 
 		 804 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  47.21 
 
 		 798 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0003  DNA gyrase subunit B  43.51 
 
 		 841 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  42.47 
 
 		 798 aa  647    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.68 
 
 		 794 aa  763    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0003  DNA gyrase subunit B  45.07 
 
 		 823 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 		 813 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  46.46 
 
 		 807 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  44.77 
 
 		 805 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  45.08 
 
 		 811 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  51.3 
 
 		 795 aa  780    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  44.87 
 
 		 824 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  46.43 
 
 		 811 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  58.01 
 
 		 643 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.72 
 
 		 637 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  50.98 
 
 		 802 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  50.56 
 
 		 795 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  47.58 
 
 		 797 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  45.03 
 
 		 813 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  45.39 
 
 		 769 aa  648    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  46.76 
 
 		 810 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  44.43 
 
 		 807 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  45.1 
 
 		 822 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  48.04 
 
 		 795 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  46.63 
 
 		 813 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3310  DNA gyrase subunit B  42.51 
 
 		 835 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  44.16 
 
 		 826 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  45.32 
 
 		 806 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  41.38 
 
 		 798 aa  636    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  46.21 
 
 		 805 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  45.57 
 
 		 806 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 		 808 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  45.82 
 
 		 813 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  45.6 
 
 		 798 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  45.08 
 
 		 811 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4460  DNA gyrase subunit B  43.66 
 
 		 823 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318757  normal  0.407237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  46.88 
 
 		 805 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  45.12 
 
 		 812 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  46.38 
 
 		 813 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  44.73 
 
 		 805 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  45.14 
 
 		 813 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 804 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0003  DNA gyrase subunit B  43.18 
 
 		 841 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  44.34 
 
 		 810 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  45.4 
 
 		 879 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  45.55 
 
 		 805 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2972  DNA gyrase, B subunit  42.24 
 
 		 858 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0506352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  44.76 
 
 		 824 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.5 
 
 		 806 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  46.63 
 
 		 815 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  44.06 
 
 		 811 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  46.85 
 
 		 805 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  44.88 
 
 		 806 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  46.86 
 
 		 807 aa  673    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 805 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  46.94 
 
 		 805 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  48.46 
 
 		 805 aa  717    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  46.29 
 
 		 805 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  42.48 
 
 		 832 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  45.92 
 
 		 800 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 824 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  45.75 
 
 		 806 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.47 
 
 		 805 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  44.5 
 
 		 812 aa  664    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  47.48 
 
 		 807 aa  719    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  44.76 
 
 		 824 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  59.43 
 
 		 628 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  49.13 
 
 		 808 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  46.37 
 
 		 812 aa  708    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 805 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  45.43 
 
 		 773 aa  656    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>