64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0958 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 
164 aa  328  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0996  peptidase C39 bacteriocin processing  41.82 
 
 
122 aa  95.5  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  31.21 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  25.9 
 
 
188 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
312 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  25.85 
 
 
223 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  26.39 
 
 
308 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  26.95 
 
 
347 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  26.03 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  24.26 
 
 
322 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
310 aa  64.3  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  23.65 
 
 
330 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
339 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  26.81 
 
 
199 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  25.37 
 
 
337 aa  57.8  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  25.74 
 
 
342 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  25.69 
 
 
244 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 
335 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  20.14 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  20.14 
 
 
326 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  22.3 
 
 
317 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  23.61 
 
 
244 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  28.7 
 
 
1400 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  23.4 
 
 
332 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  26.85 
 
 
1400 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  28.7 
 
 
1400 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  28.7 
 
 
1400 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  21.53 
 
 
267 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  25.93 
 
 
666 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  22.79 
 
 
317 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.98 
 
 
1011 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1400 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1400 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0372  hypothetical protein  27.14 
 
 
270 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  25.93 
 
 
1400 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
368 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0043  hypothetical protein  27.14 
 
 
270 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160534  normal  0.369707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  26.43 
 
 
726 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
1385 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0986  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  24.81 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1402 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  26.98 
 
 
908 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  24.82 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  28.67 
 
 
1134 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  26.09 
 
 
297 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
1038 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
1038 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2255  hypothetical protein  27.56 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 
724 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  28.57 
 
 
724 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25 
 
 
1019 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1108  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
286 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.894333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  27.49 
 
 
235 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.69 
 
 
741 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.42 
 
 
736 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  23.39 
 
 
224 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.34 
 
 
1013 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  23.13 
 
 
235 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.42 
 
 
1717 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.34 
 
 
908 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  23.77 
 
 
231 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>