131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0950 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  66.23 
 
 		 80 aa  114  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  42.86 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  36.36 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  42.47 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  40 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  41.18 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  41.79 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  52.63 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.8 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  34.67 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  35.14 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  47.27 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  47.27 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  40.28 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  39.66 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  37.5 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  40.68 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  36.36 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  38.98 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  35.71 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.88 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  47.27 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  35.71 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  37.93 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  41.82 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  37.93 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  48.08 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  32.86 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  29.73 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  30 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  31.08 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  30 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  32.86 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  32.86 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  36.21 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  29.17 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  39.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  36.21 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  30 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  35.48 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  35.59 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  35.59 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  32.39 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  32 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  30.26 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  24 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  34.78 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  37.31 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  37.29 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  37.7 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  26.67 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  31.58 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  29.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  29.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  35.19 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>