More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0944 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  100 
 
 
307 aa  627  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  36.91 
 
 
305 aa  185  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  33.78 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  35.71 
 
 
277 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.29 
 
 
300 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  35.49 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  35.49 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  35.49 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  27.46 
 
 
270 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  34.69 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  33.9 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
258 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  34.13 
 
 
277 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  34.13 
 
 
277 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  34.32 
 
 
286 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  31.49 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  33.22 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.95 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.83 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  32.51 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  34.01 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
301 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.83 
 
 
289 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  33.83 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  27.31 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  33.46 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  28.73 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.65 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
314 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.62 
 
 
280 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  28.23 
 
 
286 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
293 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
282 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  31.16 
 
 
275 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 
281 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
272 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 
281 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
288 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  31.05 
 
 
273 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  30.98 
 
 
283 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.78 
 
 
276 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.18 
 
 
285 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 
306 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.59 
 
 
285 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  28.66 
 
 
325 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  26.97 
 
 
281 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.67 
 
 
284 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  30.96 
 
 
279 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 
295 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  30.82 
 
 
281 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 
285 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  26.62 
 
 
291 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  28.4 
 
 
292 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 
289 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.42 
 
 
276 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 
286 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.05 
 
 
282 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
276 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  24.48 
 
 
281 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 
297 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.1 
 
 
316 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 
293 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 
293 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.76 
 
 
284 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  24.48 
 
 
282 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  30.6 
 
 
277 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  25.17 
 
 
286 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  30.29 
 
 
255 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.91 
 
 
285 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 
289 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 
275 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.26 
 
 
297 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.97 
 
 
281 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  24.14 
 
 
282 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  28.85 
 
 
477 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  29.41 
 
 
276 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.91 
 
 
291 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  25.78 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  25.7 
 
 
283 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.76 
 
 
613 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  25.84 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  24.9 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  24.12 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.44 
 
 
278 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  26.6 
 
 
271 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  30.22 
 
 
277 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
283 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  28.79 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  24.71 
 
 
282 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  28.51 
 
 
288 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  29.07 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>