More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0924 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  64.95 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  40.84 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  40.58 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.68 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  38.11 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  36.54 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  37.5 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  39.03 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  35.16 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  35.48 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  37.17 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  34.84 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.21 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  36.27 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  34.19 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  34.08 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  34.09 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  33.98 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  36.49 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  36.81 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  34.34 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  36.42 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  35.5 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  35.6 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  35.88 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.02 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  34.11 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  36.39 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  33.22 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  32.26 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  37.66 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  35.24 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  33.99 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  36.16 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  34.74 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  33.76 
 
 		 321 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  32.78 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.29 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  35.24 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  33.23 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  33.93 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  33.98 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  33.22 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.56 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.03 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  35.43 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  33.44 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  33.44 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  34.41 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  33.44 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  33.44 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  32.37 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  32.37 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  32.23 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  32.89 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  33.54 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  32.11 
 
 		 390 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  33.54 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  33.99 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  32.57 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  33.12 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  32.57 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.23 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  33.23 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  33.01 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  33.88 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  34.83 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  32.16 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  33.12 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  31.83 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  34.48 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  33.55 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  33.02 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  33.45 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  33.55 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  33.55 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  33.55 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  33.55 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  32.34 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  33.66 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>