More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0889 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  56.46 
 
 
638 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  56.46 
 
 
638 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  60.48 
 
 
658 aa  691    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  58.62 
 
 
637 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  59.51 
 
 
636 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  57.42 
 
 
641 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  56.33 
 
 
640 aa  677    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  57.03 
 
 
646 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  56.27 
 
 
641 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  57.79 
 
 
640 aa  691    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  56.25 
 
 
688 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  58.64 
 
 
637 aa  683    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  56.45 
 
 
639 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  56.65 
 
 
638 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2326  molecular chaperone DnaK  56.07 
 
 
650 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  58.24 
 
 
644 aa  697    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  58.08 
 
 
644 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  56.49 
 
 
638 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2132  molecular chaperone DnaK  55.52 
 
 
647 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0108492  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  55.76 
 
 
645 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  56.84 
 
 
630 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  56.58 
 
 
647 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  57.81 
 
 
634 aa  661    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  54.56 
 
 
639 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  58.28 
 
 
630 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  57.47 
 
 
629 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  57.37 
 
 
633 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  53.86 
 
 
688 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3322  molecular chaperone DnaK  56.07 
 
 
650 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  58.4 
 
 
640 aa  689    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  57.31 
 
 
638 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  57.54 
 
 
636 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  57.88 
 
 
634 aa  705    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3839  molecular chaperone DnaK  55.74 
 
 
650 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  58.95 
 
 
637 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  57.64 
 
 
639 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  58.51 
 
 
637 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  58.02 
 
 
637 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  60.16 
 
 
638 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  59.47 
 
 
637 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  55.11 
 
 
638 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  56.84 
 
 
645 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  59.74 
 
 
634 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  54.37 
 
 
749 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  58.12 
 
 
644 aa  698    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  57.87 
 
 
639 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  57.33 
 
 
612 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1308  molecular chaperone DnaK  55.74 
 
 
650 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  59.33 
 
 
632 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  55.14 
 
 
609 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  57.95 
 
 
633 aa  685    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  57.59 
 
 
635 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  56.64 
 
 
639 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  57.96 
 
 
643 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  57.62 
 
 
632 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  56.84 
 
 
640 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  54.92 
 
 
653 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1182  molecular chaperone DnaK  55.83 
 
 
638 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  57.78 
 
 
633 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  57.61 
 
 
644 aa  689    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  57.78 
 
 
632 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2456  molecular chaperone DnaK  55.36 
 
 
647 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00641905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  55.92 
 
 
648 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0552  chaperone protein DnaK  56.98 
 
 
631 aa  682    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  62.58 
 
 
644 aa  755    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  57.49 
 
 
642 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  56.62 
 
 
643 aa  670    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  58.31 
 
 
634 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0268  molecular chaperone DnaK  55.57 
 
 
650 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  59.07 
 
 
636 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  53.97 
 
 
639 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  58.41 
 
 
636 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  55.37 
 
 
632 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  57.24 
 
 
619 aa  658    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  57.14 
 
 
619 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  57.81 
 
 
635 aa  683    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  57.24 
 
 
638 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4012  molecular chaperone DnaK  56.63 
 
 
670 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  56.13 
 
 
639 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  56.13 
 
 
639 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  57.24 
 
 
671 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  56.17 
 
 
638 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  55.83 
 
 
623 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  55.5 
 
 
610 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  57.48 
 
 
636 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0646  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
650 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  57.96 
 
 
637 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0752  molecular chaperone DnaK  55.57 
 
 
650 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  56.72 
 
 
631 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  58.69 
 
 
641 aa  713    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  56.37 
 
 
653 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  56.29 
 
 
639 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  57.07 
 
 
626 aa  662    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  58.8 
 
 
636 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  59.21 
 
 
640 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
638 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2511  molecular chaperone DnaK  56.56 
 
 
637 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  58.65 
 
 
641 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  58.54 
 
 
636 aa  690    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  55.43 
 
 
654 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>