More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0863 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  100 
 
 		 346 aa  689    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.38 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.53 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  58.7 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  58.24 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  59.47 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  60.25 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.01 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.47 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  56.73 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  56.72 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.27 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  55.86 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  57.14 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.24 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 430 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  56.12 
 
 		 430 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.13 
 
 		 336 aa  335  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.76 
 
 		 482 aa  334  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.2 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  54.47 
 
 		 428 aa  331  9e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  54.82 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.99 
 
 		 464 aa  328  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.17 
 
 		 463 aa  328  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  53.45 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.47 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  56.57 
 
 		 432 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  54.34 
 
 		 428 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  54.05 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.62 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  54.07 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.62 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  54.34 
 
 		 428 aa  325  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  54.34 
 
 		 428 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  59.01 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  54.05 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  53.43 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.62 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  53.82 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  54.97 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  54.8 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  54.8 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.19 
 
 		 464 aa  322  5e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.66 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  52.46 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 428 aa  316  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 329 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 329 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.52 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  60.56 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  51.08 
 
 		 395 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.51 
 
 		 438 aa  311  7.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 347 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  51.74 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  56.06 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  52.8 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.87 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  49.57 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.81 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.81 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.41 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.21 
 
 		 408 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 357 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.38 
 
 		 397 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 440 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.41 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.75 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.46 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  59.57 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  49.7 
 
 		 439 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 372 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.1 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  52.03 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>