More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0799 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
410 aa  823    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  48.53 
 
 
418 aa  395  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  50.4 
 
 
455 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  49.6 
 
 
444 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.48 
 
 
444 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 
444 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  51.1 
 
 
438 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  51.23 
 
 
452 aa  356  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  50.14 
 
 
443 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  49.72 
 
 
443 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.65 
 
 
450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  45.01 
 
 
457 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  45.45 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  46.98 
 
 
468 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.31 
 
 
444 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.13 
 
 
476 aa  335  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.6 
 
 
439 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.09 
 
 
426 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 
438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  50.29 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  50.29 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  44.36 
 
 
481 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  43.25 
 
 
468 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  43.61 
 
 
483 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  44.58 
 
 
480 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.52 
 
 
461 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 
441 aa  322  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  49.43 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  42.72 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.7 
 
 
441 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 
422 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  49.71 
 
 
445 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 
433 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  43.03 
 
 
423 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 
438 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 
438 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.7 
 
 
432 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 
428 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  43.89 
 
 
445 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  43.89 
 
 
445 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 
446 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  45.38 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  48.56 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  44.73 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
437 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  42.38 
 
 
428 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
456 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  42.75 
 
 
535 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.69 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  42.59 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 
530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  47.51 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  42.51 
 
 
532 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  45.94 
 
 
522 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  45.94 
 
 
526 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  42.29 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  46.92 
 
 
515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  46.92 
 
 
515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  46.92 
 
 
515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  46.63 
 
 
511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  43.67 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  46.33 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  45.65 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  41.1 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  46.63 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  46.63 
 
 
524 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.63 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  46.63 
 
 
524 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  46.63 
 
 
524 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.63 
 
 
524 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.63 
 
 
524 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  42.71 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  46.33 
 
 
515 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  46.04 
 
 
521 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  44.08 
 
 
458 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  43.44 
 
 
444 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 
437 aa  300  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  43.07 
 
 
451 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  42.96 
 
 
482 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  42.96 
 
 
482 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 
457 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.17 
 
 
478 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 
456 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.26 
 
 
423 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  45.71 
 
 
434 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.04 
 
 
480 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  45.96 
 
 
479 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 
444 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  44.84 
 
 
451 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 
538 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  45.04 
 
 
479 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  42.7 
 
 
424 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  42.7 
 
 
424 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  44.61 
 
 
453 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 
472 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  44.77 
 
 
479 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>