More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0755 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 414 aa  840    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  69.44 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.54 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 		 395 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  64.94 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 394 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  68.85 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  68.13 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  68.13 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  64 
 
 		 401 aa  532  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 394 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.66 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 394 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 		 399 aa  524  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  62.34 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 406 aa  524  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 406 aa  524  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 		 389 aa  524  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 406 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.87 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 408 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.4 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.14 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.75 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  59.5 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 405 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 		 405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0361  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  63.97 
 
 		 723 aa  511  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  63 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 394 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>