57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0723 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  100 
 
 
170 aa  347  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.53 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  30.34 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  23.38 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.43 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.97 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
209 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0726  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.69 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  37.17 
 
 
152 aa  50.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  28.95 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.92 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  23.84 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.79 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  25.6 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  25.55 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  29.75 
 
 
221 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  25.48 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  26.09 
 
 
189 aa  47.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  23.62 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  27.97 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.09 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.97 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.45 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.79 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  28.38 
 
 
210 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.93 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.55 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  27.52 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  22.05 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1061  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.166141 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  24.48 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  24.48 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.81 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  26.13 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  25.4 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  24.29 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.9 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.92 
 
 
330 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.32 
 
 
186 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.92 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.13 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.52 
 
 
215 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  24.19 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>