More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0678 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  100 
 
 
525 aa  1065    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  43.36 
 
 
542 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 
511 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 
522 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.97 
 
 
535 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
532 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 
528 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
516 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 
565 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 
556 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.61 
 
 
538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  39.59 
 
 
541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 
529 aa  336  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.54 
 
 
534 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  38.22 
 
 
571 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.17 
 
 
515 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 
532 aa  329  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.18 
 
 
533 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  40.54 
 
 
515 aa  327  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
529 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
529 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 
538 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 
550 aa  323  6e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  38.51 
 
 
539 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  37.94 
 
 
609 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  36.79 
 
 
513 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  37.02 
 
 
533 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  37.35 
 
 
863 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 
555 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  36.65 
 
 
545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 
531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  38.03 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 
518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  38.43 
 
 
535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  36.58 
 
 
555 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  36.57 
 
 
556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  37.59 
 
 
531 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  36.87 
 
 
562 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
540 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
540 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  36.12 
 
 
550 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  36.94 
 
 
543 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  37.31 
 
 
540 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  37.31 
 
 
540 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  35.11 
 
 
566 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 
539 aa  309  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  36.57 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  38.12 
 
 
534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 
539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  37.83 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  36.96 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 
542 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  36.96 
 
 
531 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  38.08 
 
 
534 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
570 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
570 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
570 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  37.06 
 
 
538 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
570 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
570 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  39.12 
 
 
503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  36.99 
 
 
531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  39.11 
 
 
528 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  38.64 
 
 
533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  38.2 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  38.2 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  34.75 
 
 
566 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
535 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  36.19 
 
 
535 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 
534 aa  306  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  37 
 
 
540 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  36.67 
 
 
548 aa  306  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  39.31 
 
 
533 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  36.01 
 
 
535 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  36.65 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  36.81 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  36.57 
 
 
536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  38.79 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  36.57 
 
 
536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  37.31 
 
 
530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  35.96 
 
 
533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  38.45 
 
 
533 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  36.64 
 
 
555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  37.74 
 
 
542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  38.76 
 
 
532 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 
535 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  37.55 
 
 
534 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  38.57 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  35.78 
 
 
535 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>