49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0672 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 169 aa  333  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  51.79 
 
 		 171 aa  190  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.65 
 
 		 173 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  46.54 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.77 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  43.98 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.37 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.69 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  31.06 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.49 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  39.16 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  38.41 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  34.16 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  39.26 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  35.85 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.54 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  33.95 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.41 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  40 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  34.73 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.52 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.95 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  31.25 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  34.94 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  33.73 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  38.04 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  30 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.49 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  35.76 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33.54 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  38.18 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  34.57 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.9 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.95 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.54 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  36.81 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  35.66 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  29.01 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  29.65 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  25.31 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  28.99 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.45 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  24.26 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0383  putative PAS/PAC sensor protein  27.36 
 
 		 227 aa  40.8  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>