More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0638 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  100 
 
 		 444 aa  882    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  51.93 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.9 
 
 		 445 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.69 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.13 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  48.99 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  51.01 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.05 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  48.67 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.53 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  49 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 449 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 449 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  46.61 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  46.95 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.64 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  47.78 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  48.75 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  47.96 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  46.58 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  48.49 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.3 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.14 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.67 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  48.57 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  47.78 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  46.12 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  50.6 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  46.92 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.36 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  46.92 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  47.25 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  48.11 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  45.73 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  46.87 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  48.46 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  48.46 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  47.02 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  45.8 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  48.11 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  44.52 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.51 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  45.31 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  44.52 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  47.51 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.7 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  46.54 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  46 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  45.39 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  46.54 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  46.54 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  45.43 
 
 		 457 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  46.42 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  46.5 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  43.42 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  45.85 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.13 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  45.39 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  45.73 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  45.96 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  44.37 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  46.94 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  45.81 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  45.39 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  45.5 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.93 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  47.39 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  45.12 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  46.7 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  45.12 
 
 		 485 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  44.39 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  44.6 
 
 		 441 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  44.39 
 
 		 449 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  46.65 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  47.82 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  48.33 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  47.03 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  47.61 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  47.61 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  45.25 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  47.61 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>