More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0604 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  100 
 
 
333 aa  683    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  57.79 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  43.17 
 
 
333 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  42.27 
 
 
364 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  43.48 
 
 
344 aa  289  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  43.99 
 
 
332 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  44.48 
 
 
321 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  42.22 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  41.61 
 
 
332 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  42.59 
 
 
335 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  42.59 
 
 
335 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  41.51 
 
 
376 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  42.14 
 
 
328 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  41.67 
 
 
320 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  42.14 
 
 
328 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  40.63 
 
 
332 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  43.99 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  40 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  40 
 
 
332 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  40.32 
 
 
332 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  40.68 
 
 
333 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  41.14 
 
 
334 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  42.17 
 
 
329 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  41.9 
 
 
329 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  40.06 
 
 
321 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  41.34 
 
 
359 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  42.26 
 
 
366 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.2 
 
 
370 aa  251  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.62 
 
 
388 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  40.06 
 
 
326 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.62 
 
 
368 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  40.62 
 
 
368 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  42.55 
 
 
333 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  40.33 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  37.34 
 
 
412 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.24 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.06 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  37.3 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.89 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  40.13 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  37.66 
 
 
374 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  42.77 
 
 
338 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  40.19 
 
 
363 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  37.38 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  37.9 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  38.23 
 
 
375 aa  231  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.34 
 
 
368 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  36.73 
 
 
370 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  37.27 
 
 
321 aa  229  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  39.5 
 
 
319 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  41.12 
 
 
325 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  38.89 
 
 
316 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.94 
 
 
341 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  38.27 
 
 
320 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  36.95 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.74 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  39.18 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  41.45 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  38.89 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  36.79 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.05 
 
 
326 aa  219  5e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  38.89 
 
 
361 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  34.38 
 
 
324 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  35.87 
 
 
358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  36.3 
 
 
335 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  34.06 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.95 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  36.75 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  36.91 
 
 
321 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  34.49 
 
 
331 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  34.98 
 
 
349 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  36.54 
 
 
322 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  32.49 
 
 
321 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.71 
 
 
330 aa  205  9e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  34.58 
 
 
411 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.59 
 
 
324 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  34.29 
 
 
331 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  40.35 
 
 
337 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  37.5 
 
 
333 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  33.65 
 
 
331 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  34.97 
 
 
331 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  42.61 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  34.6 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  42.61 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  36.6 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  34.94 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.85 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  35.09 
 
 
340 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  34.53 
 
 
330 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  34.31 
 
 
368 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  35.24 
 
 
331 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  34.78 
 
 
337 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  35.24 
 
 
331 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  35.24 
 
 
331 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>