More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0581 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
424 aa  870  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.71 
 
 
436 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.76404e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
445 aa  180  5e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.33 
 
 
427 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 
432 aa  167  3e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  39 
 
 
489 aa  165  1e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
529 aa  165  1e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 
489 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  36.23 
 
 
490 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  38.33 
 
 
492 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  26.65 
 
 
447 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  41.4 
 
 
489 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 
424 aa  154  3e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 
443 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 
489 aa  148  2e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  27.41 
 
 
442 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
453 aa  147  4e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  36.4 
 
 
493 aa  146  7e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  41.51 
 
 
264 aa  146  8e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  28.84 
 
 
445 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  26.5 
 
 
423 aa  140  5e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 
392 aa  135  2e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
284 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 
494 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
278 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 
475 aa  132  8e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.94 
 
 
479 aa  132  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  36.41 
 
 
365 aa  132  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  3.43868e-06  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.13 
 
 
478 aa  132  1e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  27.25 
 
 
480 aa  130  5e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
292 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.9 
 
 
292 aa  129  7e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
280 aa  129  1e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  36.14 
 
 
479 aa  128  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.75 
 
 
481 aa  128  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  34.8 
 
 
483 aa  128  2e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.21 
 
 
518 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 
640 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.88 
 
 
486 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 
479 aa  126  8e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 
493 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  30.03 
 
 
490 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 
504 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  29.91 
 
 
489 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
567 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  28.28 
 
 
569 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  27.08 
 
 
473 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.36 
 
 
294 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 
489 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 
489 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 
489 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  35.43 
 
 
485 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 
489 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
268 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.68 
 
 
513 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.62 
 
 
484 aa  121  2e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  29.57 
 
 
486 aa  121  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  27.03 
 
 
487 aa  121  2e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  30.53 
 
 
489 aa  122  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
262 aa  120  4e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  27.03 
 
 
487 aa  120  4e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  27.03 
 
 
487 aa  120  4e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.6 
 
 
480 aa  120  4e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  34.96 
 
 
284 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
487 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  28.8 
 
 
485 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  31.27 
 
 
486 aa  119  8e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.63 
 
 
268 aa  119  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  36.16 
 
 
470 aa  119  1e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.90245e-07  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 
489 aa  119  1e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  30 
 
 
484 aa  119  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 
474 aa  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 
489 aa  119  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 
489 aa  119  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  1.08832e-09 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 
282 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  27.97 
 
 
561 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
483 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
488 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  29.75 
 
 
486 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  36.71 
 
 
528 aa  117  4e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  31.67 
 
 
478 aa  117  4e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 
307 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.03 
 
 
481 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 
289 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  26.63 
 
 
474 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 
487 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  27.72 
 
 
573 aa  116  7e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  31.67 
 
 
478 aa  116  7e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.57 
 
 
487 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
490 aa  115  1e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.57 
 
 
487 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.57 
 
 
487 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.57 
 
 
487 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.57 
 
 
487 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>