More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0569 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  35.91 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  45.63 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.55 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  41.9 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  41.9 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  34.11 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  40.95 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  42.86 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  42.86 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  35.92 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  29.58 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  44.64 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  40 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  42.45 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  35.92 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  33.8 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  29.82 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  29.91 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  39.81 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  41.12 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  33.64 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  30.36 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  41.18 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  31.48 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  41.12 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  49.51 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  38.96 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  35.81 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  40.78 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  39.62 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 253 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  40.78 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  91.7  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  43.27 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  38.83 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  35.04 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  37.36 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 274 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  35.06 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  31.48 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.37 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  31.43 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  31.31 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  34.68 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  28.99 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  27.23 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  30.08 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  29.44 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>