More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0542 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 188 aa  362  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  31.35 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  38.51 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  41.03 
 
 		 212 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  38.75 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  31.32 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  36.02 
 
 		 212 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  36.02 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  30.81 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  31.38 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  31.67 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  29.59 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  28.99 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28.74 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  29.31 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  28.99 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  28.41 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  26.88 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  28.99 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  30.13 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  32.75 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.49 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  28.85 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  27.39 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  28.97 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  26.79 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  28.28 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.14 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  31.18 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  33.87 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  33.87 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  25.95 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  30.13 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  28.19 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  26.55 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  25.15 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  31.68 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.32 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  27.03 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  28.72 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  25.9 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.32 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  27.1 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.5 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  26.78 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  24.6 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.22 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  23.81 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.44 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  24.32 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.03 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  25.74 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.85 
 
 		 682 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  28 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 682 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  27.43 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  24.44 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  25.16 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  25.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  24.52 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  24.52 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  24 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  26.76 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.34 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>