More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0540 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
304 aa  631  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
307 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
316 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 
316 aa  341  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
316 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
316 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
316 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 
316 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 
316 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
303 aa  334  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 
303 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
304 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 
303 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
305 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
305 aa  325  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
312 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
315 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
303 aa  324  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
312 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
313 aa  318  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
355 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
302 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
309 aa  317  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
308 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
302 aa  317  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
318 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
323 aa  315  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
318 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1002  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.407941  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 
309 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
305 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
302 aa  309  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
305 aa  309  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
340 aa  308  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
309 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 
312 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  48.31 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
317 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
323 aa  301  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 
309 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  48.81 
 
 
318 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
309 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
298 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
309 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
305 aa  298  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
309 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
300 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  45.64 
 
 
318 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14241  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
308 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.256907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
303 aa  297  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
304 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
338 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
312 aa  296  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
304 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
304 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
316 aa  296  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
321 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
312 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
315 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
313 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
304 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
310 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
300 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
313 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  45.6 
 
 
311 aa  291  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.5 
 
 
317 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
309 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
308 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
307 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
300 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
305 aa  289  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
297 aa  288  7e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
312 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
308 aa  287  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 
304 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
312 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>