More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0466 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  56.99 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  51.58 
 
 
96 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  51.04 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  48.42 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  43.75 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  43.75 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  49.48 
 
 
101 aa  94  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.22 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  51.58 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  53.41 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  43.16 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  45 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  46 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  42.42 
 
 
102 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  42.11 
 
 
119 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  41.05 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  41.94 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  84.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  38.95 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.57 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 
107 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  44.68 
 
 
131 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  43.48 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  43.01 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  42 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  45.74 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  41.67 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  37.76 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  39.39 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  45.74 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  41.94 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  48.42 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  42.7 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  43 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
238 aa  80.5  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  42.39 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  43.62 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  47.78 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  37.78 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  37.63 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  39.39 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  39 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  39.56 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  37.62 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  39.13 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  37.89 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  41.49 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  38.38 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.57 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  40.22 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  40.82 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.78 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  34.74 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  40.62 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  39.13 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  35.05 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  36.63 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  38.38 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.55 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  37 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.17 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  43.75 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  42.55 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  42.05 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  42.55 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  39.78 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  39.78 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  39.36 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.31 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>