49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0431 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  100 
 
 
107 aa  208  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1579  cytochrome c class I  64.71 
 
 
185 aa  116  8e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00145947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0958  cytochrome c551/c552-like protein  47.06 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  36.61 
 
 
104 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  35.71 
 
 
104 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
106 aa  56.2  1e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  34.12 
 
 
108 aa  51.2  5e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  37.84 
 
 
104 aa  51.2  5e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2197  cytochrome c, class I  43.64 
 
 
106 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.353162  hitchhiker  0.00157135 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  40 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  30.28 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  30.63 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  32.74 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  32.74 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  32.74 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0916  C-type cytochrome, putative  31.86 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  30.59 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  35.24 
 
 
202 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  9.01223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  31.25 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  32.14 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  32.98 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  32.14 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  26.32 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  35.51 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  33.93 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
800 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  34.58 
 
 
100 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  2.95238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  28.92 
 
 
360 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.29 
 
 
388 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  31.33 
 
 
348 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  32.71 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32.11 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.35471e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  31.48 
 
 
327 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  32.95 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  30.59 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  36.08 
 
 
457 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  34.26 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1438  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423829  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  36.61 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  40.48 
 
 
918 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  39.64 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  36.61 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  34.04 
 
 
444 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  32.56 
 
 
101 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  29.35 
 
 
446 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  33.68 
 
 
1151 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  30.36 
 
 
112 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  28.3 
 
 
108 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>