238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0429 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0429  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
266 aa  516  1e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.0559e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 
278 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.53378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  27.67 
 
 
271 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  26.77 
 
 
279 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.05 
 
 
271 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.60033e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  26.59 
 
 
268 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.8 
 
 
271 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.38241e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.35 
 
 
271 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  26.29 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.24 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  25.6 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.05 
 
 
309 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.05 
 
 
282 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  26.4 
 
 
284 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  29.13 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.86 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.95 
 
 
283 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.2 
 
 
282 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.53743e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.48 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.44 
 
 
395 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  27 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7273e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  24.15 
 
 
407 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.95 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.43711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  23.77 
 
 
395 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  23.77 
 
 
401 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  26.34 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.76179e-07  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.05 
 
 
395 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  25.66 
 
 
275 aa  84.3  2e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.86 
 
 
283 aa  84.3  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  26.92 
 
 
329 aa  84.7  2e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  25.34 
 
 
366 aa  83.2  4e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  23.02 
 
 
379 aa  82  8e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  27.06 
 
 
283 aa  81.6  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.71 
 
 
309 aa  80.5  3e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  23.66 
 
 
315 aa  80.1  3e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  27.34 
 
 
378 aa  80.5  3e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  25.63 
 
 
324 aa  80.1  4e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  28.47 
 
 
396 aa  79.7  5e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  24.44 
 
 
391 aa  79.7  5e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  30.86 
 
 
309 aa  79.3  5e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  30.92 
 
 
309 aa  79  7e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.46 
 
 
358 aa  79.3  7e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 
396 aa  78.6  1e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.97 
 
 
330 aa  78.2  1e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.43 
 
 
401 aa  78.2  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  4.022e-08 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 
396 aa  78.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.68 
 
 
405 aa  78.6  1e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.8 
 
 
396 aa  78.6  1e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.8 
 
 
396 aa  78.2  1e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  21.8 
 
 
396 aa  78.2  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  21.43 
 
 
403 aa  77.4  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.43 
 
 
396 aa  77.4  2e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.73 
 
 
328 aa  77.8  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  23.97 
 
 
396 aa  77.4  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  24.81 
 
 
285 aa  77  3e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.7 
 
 
346 aa  76.6  3e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  24.57 
 
 
315 aa  77  3e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  22.88 
 
 
304 aa  77  3e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.69 
 
 
321 aa  76.6  4e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  27.63 
 
 
274 aa  76.6  4e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  21.59 
 
 
381 aa  76.3  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  25.79 
 
 
275 aa  76.3  5e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.1 
 
 
333 aa  76.3  5e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 
396 aa  76.3  5e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  21.8 
 
 
396 aa  75.9  7e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 
396 aa  75.5  8e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 
396 aa  75.5  8e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 
396 aa  75.5  8e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 
396 aa  75.5  8e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  21.43 
 
 
396 aa  75.5  9e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  21.43 
 
 
408 aa  75.5  9e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.98 
 
 
358 aa  75.5  9e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  22.47 
 
 
304 aa  75.1  1e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  25.49 
 
 
278 aa  75.1  1e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  23.4 
 
 
324 aa  74.3  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.41853e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.47 
 
 
330 aa  73.9  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  24.15 
 
 
327 aa  74.3  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  27.5 
 
 
312 aa  73.9  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.32 
 
 
349 aa  74.7  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.62 
 
 
394 aa  73.9  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 
334 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  29.58 
 
 
320 aa  73.9  3e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 
334 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  25.1 
 
 
275 aa  73.9  3e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  25.23 
 
 
334 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  22.18 
 
 
326 aa  73.2  4e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.33 
 
 
341 aa  73.2  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  20.22 
 
 
405 aa  73.2  4e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.33 
 
 
341 aa  73.2  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 
270 aa  72.8  5e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.09 
 
 
258 aa  72.8  6e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  24.12 
 
 
327 aa  72.8  6e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  21.96 
 
 
390 aa  72  8e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 
328 aa  72  9e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  23.01 
 
 
397 aa  71.6  1e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  24.62 
 
 
325 aa  71.6  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  24.44 
 
 
318 aa  71.2  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>