128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0395 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  100 
 
 
511 aa  1021    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  35.42 
 
 
535 aa  286  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  25.64 
 
 
452 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  26.03 
 
 
452 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  24.21 
 
 
484 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  30.45 
 
 
457 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  25.16 
 
 
454 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  24.33 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  24.38 
 
 
461 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.6 
 
 
454 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  25.3 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  28.36 
 
 
457 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  29.79 
 
 
457 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  25.48 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  27.46 
 
 
455 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  27.84 
 
 
461 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  28.73 
 
 
458 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  27.84 
 
 
461 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  26.9 
 
 
678 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  24 
 
 
719 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  25.47 
 
 
679 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  24.31 
 
 
718 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  24.31 
 
 
725 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  24.31 
 
 
718 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  24.31 
 
 
725 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  24.31 
 
 
718 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  24.31 
 
 
718 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  24.77 
 
 
737 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  28.57 
 
 
459 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  26.48 
 
 
700 aa  94  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  23.62 
 
 
553 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  25.66 
 
 
461 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  24.77 
 
 
737 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  24.77 
 
 
737 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  24.46 
 
 
738 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  27.99 
 
 
664 aa  90.5  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  24.15 
 
 
738 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  24.15 
 
 
740 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  24.06 
 
 
738 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  23.66 
 
 
742 aa  87  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25.76 
 
 
457 aa  87  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  22.78 
 
 
701 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  23.77 
 
 
741 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  25.41 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  22.52 
 
 
739 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  25.19 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  28.27 
 
 
541 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.61 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  26.71 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  22.98 
 
 
740 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  29.25 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  24.38 
 
 
660 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  22.67 
 
 
734 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  28.26 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  28.53 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  28.09 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  22.4 
 
 
670 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.36 
 
 
737 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  22.67 
 
 
734 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  27.33 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.24 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  21.6 
 
 
733 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  25.69 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.57 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  23.96 
 
 
679 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  27.08 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  27.08 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  27.08 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  26.32 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  30.16 
 
 
541 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  21.56 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  21.41 
 
 
750 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  23.08 
 
 
727 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  22.7 
 
 
724 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  22.9 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  25.14 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  22.51 
 
 
700 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.08 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 
791 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.31 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  21.85 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  19.18 
 
 
694 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  21.85 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25 
 
 
428 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.63 
 
 
429 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.65 
 
 
432 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  23.49 
 
 
732 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24 
 
 
395 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.41 
 
 
782 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  22.26 
 
 
717 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  22.26 
 
 
717 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  29.75 
 
 
883 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  23.61 
 
 
550 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  23.61 
 
 
550 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  23.61 
 
 
550 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  21.67 
 
 
538 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  20.88 
 
 
603 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  23.49 
 
 
722 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.43 
 
 
560 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>