More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0373 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  211  2e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  63.46 
 
 
108 aa  148  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  64.65 
 
 
107 aa  146  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  64.65 
 
 
107 aa  146  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  64.65 
 
 
107 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  63.64 
 
 
124 aa  144  4e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  63.64 
 
 
148 aa  144  4e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  61.62 
 
 
107 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  64.95 
 
 
115 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  61.62 
 
 
107 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  61.62 
 
 
107 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  63.64 
 
 
107 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  64.29 
 
 
107 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  61.62 
 
 
107 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  62.63 
 
 
106 aa  137  5e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  58.65 
 
 
108 aa  137  5e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  63.27 
 
 
107 aa  137  5e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  58.65 
 
 
108 aa  136  9e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  59 
 
 
125 aa  135  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  63.83 
 
 
110 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  59.6 
 
 
107 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  61.29 
 
 
123 aa  135  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  59.18 
 
 
107 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  60.61 
 
 
106 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  60 
 
 
110 aa  132  1e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  58.76 
 
 
107 aa  132  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  57.69 
 
 
108 aa  132  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  58.76 
 
 
109 aa  131  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  130  4e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  57.28 
 
 
109 aa  130  4e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  130  4e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  56 
 
 
109 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  130  7e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  56.19 
 
 
108 aa  130  8e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  59.18 
 
 
105 aa  130  8e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  57.69 
 
 
108 aa  130  8e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.55412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  54.81 
 
 
120 aa  129  1e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  57 
 
 
107 aa  129  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  129  2e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  54.29 
 
 
108 aa  129  2e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  128  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  55.24 
 
 
110 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  127  4e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  127  4e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  57.58 
 
 
109 aa  127  5e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  55.24 
 
 
108 aa  127  5e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  58.7 
 
 
105 aa  127  5e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.71604e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.15955e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  53.85 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.36523e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  53 
 
 
114 aa  127  7e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  54.81 
 
 
108 aa  126  8e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  126  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  126  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.76713e-08  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  126  1e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  60.2 
 
 
106 aa  126  1e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  54.81 
 
 
108 aa  126  1e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  58.06 
 
 
107 aa  125  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  57.58 
 
 
109 aa  125  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  53.06 
 
 
108 aa  125  2e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  55.1 
 
 
107 aa  125  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  53.47 
 
 
259 aa  125  2e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  51 
 
 
109 aa  125  2e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  125  2e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  56.52 
 
 
107 aa  125  2e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  56.31 
 
 
110 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  53 
 
 
109 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  58.7 
 
 
105 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  51.92 
 
 
112 aa  125  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  1.21318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  51.92 
 
 
112 aa  125  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.65425e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  54.81 
 
 
112 aa  124  4e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  55.91 
 
 
106 aa  124  4e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  55.91 
 
 
119 aa  124  4e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  55.91 
 
 
106 aa  124  4e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  51.43 
 
 
133 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  54.55 
 
 
110 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  53.06 
 
 
107 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  56.12 
 
 
106 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  53 
 
 
106 aa  123  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>