More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0337 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  23.36 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.16 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.13 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  26.26 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.94 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  19.11 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.17 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  21.24 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  22.67 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  23.31 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.25 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  22.33 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.21 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.08 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  25.62 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  24.14 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  24.04 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1035  UspA domain protein  23.33 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.7 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  24.41 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  21.84 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.49 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.25 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  22.84 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  21.28 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  21.07 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  21.82 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  19.47 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  20.68 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  20.72 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  21.95 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  20.82 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.67 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  21.21 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  20.93 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  23.15 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  23.33 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 141 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  21.89 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  21.71 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.59 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.33 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.03 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  20.27 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  23.71 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  22.18 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.45 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  20.13 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  27.42 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  25.54 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  22.19 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  22.6 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  22.56 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  21.4 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  22.22 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  23.1 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  21.85 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  22.69 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 140 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  22.45 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  24.57 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  23.53 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  22.03 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  20.14 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  20.96 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  22.41 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.13 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.73 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  21.21 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  20.96 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  22.95 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.25 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.62 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  23.2 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  20.07 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25.85 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  26.17 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.66 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  30.82 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  25.31 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>