More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0336 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 557 aa  1101    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 		 553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.32 
 
 		 603 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 567 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1676 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.21 
 
 		 573 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.14 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  31.28 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 594 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 		 599 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.15 
 
 		 593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  31.94 
 
 		 677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 576 aa  130  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.73 
 
 		 572 aa  127  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  28.51 
 
 		 593 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 592 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 		 592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 934 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 621 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.7 
 
 		 837 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.81 
 
 		 729 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  29.43 
 
 		 621 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 722 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  28.49 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 729 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.17 
 
 		 566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 610 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 566 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 		 571 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 575 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 		 591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 621 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.34 
 
 		 619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 617 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 607 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 572 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.05 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 607 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.38 
 
 		 573 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 931 aa  107  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 633 aa  107  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  25.86 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 599 aa  104  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 633 aa  104  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 860 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.57 
 
 		 2240 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  24.54 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.96 
 
 		 936 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  32.24 
 
 		 616 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 603 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 574 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  28.62 
 
 		 594 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 619 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.8 
 
 		 1979 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  28.43 
 
 		 625 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.3 
 
 		 575 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 612 aa  97.8  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.44 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  25.13 
 
 		 613 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  26.32 
 
 		 575 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>