More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0312 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  75.97 
 
 
235 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  56.83 
 
 
231 aa  262  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  52.97 
 
 
232 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  54.66 
 
 
232 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  54.24 
 
 
234 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  56.44 
 
 
230 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 
230 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  52.97 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  52.97 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  53.68 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  53.68 
 
 
234 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  53.68 
 
 
234 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  52.54 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  52.3 
 
 
232 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.86 
 
 
233 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 
235 aa  191  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.78 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.42 
 
 
237 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
264 aa  184  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
240 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  40.85 
 
 
252 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.62 
 
 
225 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.62 
 
 
225 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  41.48 
 
 
251 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  42.92 
 
 
228 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  41.92 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  39.06 
 
 
232 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.6 
 
 
255 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  40.95 
 
 
240 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  39.57 
 
 
241 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  41.99 
 
 
224 aa  174  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.79 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  40.61 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.98 
 
 
242 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
228 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  42.17 
 
 
240 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  39.04 
 
 
254 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  40.61 
 
 
246 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  41.95 
 
 
298 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  37.18 
 
 
230 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.36 
 
 
245 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  40.87 
 
 
231 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  41.2 
 
 
246 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  40.6 
 
 
227 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  43.35 
 
 
235 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.99 
 
 
228 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 
259 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  40.17 
 
 
230 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  38.46 
 
 
235 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 
237 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  40.17 
 
 
260 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1582  ABC transporter related  43.91 
 
 
254 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000305308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  40.73 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1409  ABC transporter related  38.26 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.773805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  40.34 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  39.91 
 
 
246 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  36.44 
 
 
228 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  39.47 
 
 
241 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.03 
 
 
230 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  37.71 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  39.74 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  38.53 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  37.44 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.26 
 
 
225 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  36.55 
 
 
233 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  37.66 
 
 
249 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  41.56 
 
 
225 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  37.66 
 
 
293 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  38.96 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  37.45 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40.09 
 
 
217 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.35 
 
 
248 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  38.05 
 
 
235 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
227 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.24 
 
 
225 aa  161  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 
231 aa  161  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  36.1 
 
 
654 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1448  ABC transporter related  41.23 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  36.32 
 
 
228 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.69 
 
 
244 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4324  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 
248 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
225 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  38.36 
 
 
315 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  36.91 
 
 
244 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>