More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0296 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  86.67 
 
 		 135 aa  236  6.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  87.7 
 
 		 134 aa  219  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 		 136 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  81.02 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  84 
 
 		 128 aa  213  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  213  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  213  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  79.1 
 
 		 134 aa  211  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  210  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  78.52 
 
 		 135 aa  210  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  81.97 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  81.75 
 
 		 142 aa  206  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  81.3 
 
 		 124 aa  204  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 135 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  203  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  80.49 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  203  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 127 aa  202  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  202  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  82.11 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  78.74 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  72.14 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  201  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 202 aa  200  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  199  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  200  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  77.21 
 
 		 137 aa  199  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>