More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0291 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  55.35 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 205 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.15 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  47.09 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  40.95 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.09 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1418  ribosomal protein L3  48.24 
 
 		 259 aa  180  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.710723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  42.33 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 205 aa  178  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 212 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  42.33 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  42.33 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  43.98 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  43.52 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  46.01 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  44.17 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 209 aa  176  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  43.52 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 216 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  45.19 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>