More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0286 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  55.05 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  51.82 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.53 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  50.45 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  48.57 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  52.94 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  52.43 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  43.97 
 
 		 121 aa  100  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.98 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  51.46 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  43.59 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  45.28 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  52.53 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  43.22 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3662  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50.98 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  50.47 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  50.96 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  49.51 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>