29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0224 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  36.59 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  32.67 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  29.07 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  28.83 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  29.55 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  27.85 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  26.74 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  27.36 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  30.48 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  27.71 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  26.74 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  32.93 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  27.37 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  22.76 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  26.74 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  30.53 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  26.19 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  26.74 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  27.12 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>