More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0208 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 441 aa  889    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.44 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  46.1 
 
 		 434 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  43.93 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 434 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  41.88 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  44.5 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  43.1 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  40.2 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  41.27 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.41 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  41.87 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  42.45 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  42.24 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  48.72 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  40.67 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  40.84 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  40.34 
 
 		 450 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.22 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  39.54 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  44.39 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.36 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  38.99 
 
 		 422 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  39.75 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  37.71 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.71 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 		 425 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 439 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 		 420 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 		 428 aa  292  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  39.36 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.09 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.03 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 428 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  37.77 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.04 
 
 		 423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  35.06 
 
 		 427 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 449 aa  285  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  36.99 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  37.23 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>