83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0179 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 331 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  24.76 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  25.35 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.33 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.68 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  32.79 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.86 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.17 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  22.33 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  29.51 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.15 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.38 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  20.69 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  27.6 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  25.62 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  30.56 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  30.56 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  28.85 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  22.48 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.64 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0462  DNA polymerase III, delta subunit superfamily protein  25.57 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0321349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  19.86 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  23.53 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28.33 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3088  hypothetical protein  25.56 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.625478 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  23.97 
 
 		 481 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  26.32 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  19.74 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  20.07 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.86 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20.46 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  25.69 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  25.66 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  29.76 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  25.7 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  24 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2441  hypothetical protein  26.9 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  22.26 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  23.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  30 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  29.09 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  25.82 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  25.74 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.36 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  28.09 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.42 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.47 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  31.07 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>