More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0155 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  50 
 
 		 275 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  51.09 
 
 		 278 aa  275  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  47.45 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  49.09 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  49.09 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  48.73 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  49.46 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  48.54 
 
 		 279 aa  268  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  46.38 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  41.82 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  44.2 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  44.2 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  43.68 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  48.19 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  47.83 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  45.09 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  47.1 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  47.83 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  46.93 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  45.65 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  46.74 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  43.54 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  43.53 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  40.94 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  40.29 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  42.18 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  43.42 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  41.7 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  41.84 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  41.82 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  44.73 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  41.7 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  40.36 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  41.3 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  40.36 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  38.97 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  38.27 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  44.65 
 
 		 748 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  38.38 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  36.96 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  39.58 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  42.96 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  37.09 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  37.45 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  39.76 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  36.96 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  36.96 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  36.96 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  36.73 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  36.58 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  36.68 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  36.29 
 
 		 288 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  37.72 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  36.58 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  36.65 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  37.46 
 
 		 312 aa  194  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  36.76 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  36.29 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  35.77 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  35.77 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  35.38 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  41.83 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  36.51 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  35.43 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  36.51 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  36.11 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  36.47 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  36.25 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  40 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  40.25 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  40.25 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  36.19 
 
 		 287 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  35.29 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  41.83 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  35 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  34.9 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  34.9 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  35.16 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  36.95 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  39.27 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  33.45 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  44.13 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  36.47 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  41.1 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>