More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0151 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.65 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.73 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.95 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  47.73 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  43.12 
 
 		 229 aa  90.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.6 
 
 		 478 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.6 
 
 		 478 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  39.67 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.13 
 
 		 568 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  45.63 
 
 		 478 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  45.63 
 
 		 484 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.63 
 
 		 478 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.63 
 
 		 478 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  37.19 
 
 		 170 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  45.63 
 
 		 484 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.65 
 
 		 395 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  42.24 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  39.62 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.48 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 		 478 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 269 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  40.78 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  42.59 
 
 		 346 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  45.16 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  45.16 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40.74 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.28 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  34.21 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  42.48 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  40.74 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.29 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  42.53 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  45.21 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  33.94 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  46.67 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  35.78 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  36.79 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  41.57 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  43.84 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  36.7 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.22 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  35.09 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  32.99 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>