86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0148 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  53.95 
 
 
302 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  54.49 
 
 
310 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  54.66 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  54.49 
 
 
310 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  53.92 
 
 
305 aa  320  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  54.1 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  49.67 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  47.23 
 
 
305 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  52.46 
 
 
303 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  49.49 
 
 
293 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  52.92 
 
 
306 aa  275  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  46.05 
 
 
304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  48.21 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  43.59 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  43.49 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  44.16 
 
 
302 aa  244  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  39.16 
 
 
307 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  40.78 
 
 
305 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  43.65 
 
 
305 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  43.65 
 
 
305 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  37.66 
 
 
306 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  39.74 
 
 
306 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  39.16 
 
 
304 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40.95 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  38.49 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  35.39 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  35.39 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.01 
 
 
304 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  34.52 
 
 
304 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  33.55 
 
 
297 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  49.58 
 
 
128 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  28.67 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  28.81 
 
 
296 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  29.03 
 
 
454 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  27.76 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  27.24 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.64 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  29.86 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.69 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.98 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  27.65 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.57 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  23.81 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.9 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  40 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  29.13 
 
 
609 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  29.13 
 
 
609 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.48 
 
 
421 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  27.78 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  28.74 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.24 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.71 
 
 
154 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  34.85 
 
 
450 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.71 
 
 
154 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  32.48 
 
 
125 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.95 
 
 
493 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.71 
 
 
154 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25.71 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.85 
 
 
230 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.19 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.85 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  26.39 
 
 
493 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  30.16 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.7 
 
 
454 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.7 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.17 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.2 
 
 
440 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.85 
 
 
447 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  26.17 
 
 
374 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  34.96 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  28.07 
 
 
262 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  27.61 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  35.94 
 
 
70 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.82 
 
 
454 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  32 
 
 
171 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  34.44 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.78 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.78 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0213  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  24.54 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  31.58 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  36.36 
 
 
193 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.82 
 
 
454 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.23 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>