More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0139 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  62.48 
 
 		 619 aa  786    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  49.27 
 
 		 617 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  100 
 
 		 616 aa  1256    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  49.92 
 
 		 609 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  49.84 
 
 		 615 aa  622  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  49.68 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  48.71 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  48.79 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  48.87 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  48.55 
 
 		 602 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  48.05 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  48.05 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  48.87 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  48.86 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  49.19 
 
 		 602 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  49.1 
 
 		 607 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  48.94 
 
 		 607 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  49.18 
 
 		 599 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  48.06 
 
 		 602 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  47.38 
 
 		 604 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  46.42 
 
 		 608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  48.69 
 
 		 573 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  47.6 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  47.3 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  47.46 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  46.81 
 
 		 567 aa  554  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  47.39 
 
 		 571 aa  552  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  47.31 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  44.61 
 
 		 595 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  46.15 
 
 		 569 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  46.48 
 
 		 568 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  43.04 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  44.94 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  45.17 
 
 		 633 aa  535  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  44.91 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  44.69 
 
 		 614 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  44.01 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  44.22 
 
 		 607 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  43.99 
 
 		 608 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  56.92 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  45.11 
 
 		 587 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  44.68 
 
 		 582 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  44.16 
 
 		 605 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  45 
 
 		 592 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  43.3 
 
 		 611 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  43.46 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  44.05 
 
 		 599 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  44.28 
 
 		 606 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  43.13 
 
 		 596 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  45.02 
 
 		 582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  43.4 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  43.56 
 
 		 607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  43.81 
 
 		 582 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  45.01 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  45.25 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  43.55 
 
 		 596 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  44.07 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  42.1 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  44.14 
 
 		 594 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  52.59 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  43.3 
 
 		 611 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  46.02 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  44.9 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  44.5 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  44.73 
 
 		 624 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  42.79 
 
 		 597 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1525  pyruvate carboxylase subunit B  42.86 
 
 		 643 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000118935  normal  0.0137179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  44.33 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  41.34 
 
 		 604 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  42.88 
 
 		 590 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  41.79 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  41.17 
 
 		 602 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  42.59 
 
 		 634 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  42.72 
 
 		 590 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0558  pyruvate carboxylase subunit B  43.4 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0745803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  42.88 
 
 		 590 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  41.37 
 
 		 604 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  42.58 
 
 		 589 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  43.84 
 
 		 593 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  42.08 
 
 		 594 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  42.42 
 
 		 589 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  42.28 
 
 		 604 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  42.46 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  42.56 
 
 		 588 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  54.75 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  42.26 
 
 		 589 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  53.05 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  42.56 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  42.26 
 
 		 589 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  42.39 
 
 		 591 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  41.61 
 
 		 603 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  51.84 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1864  oxaloacetate decarboxylase  53.85 
 
 		 458 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00728685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3508  pyruvate carboxylase subunit B  43.86 
 
 		 621 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000543633  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  42.39 
 
 		 591 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  54.98 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1755  oxaloacetate decarboxylase  52.87 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  54.52 
 
 		 462 aa  482  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  40.93 
 
 		 690 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2433  oxaloacetate decarboxylase  50.67 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>