More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0113 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
373 aa  740    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.64 
 
 
310 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  36.04 
 
 
284 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.49 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  35.45 
 
 
282 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.15 
 
 
284 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  34.85 
 
 
284 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  35.15 
 
 
283 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  36.16 
 
 
285 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.45 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.7 
 
 
444 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  32.97 
 
 
444 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.39 
 
 
438 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  35.51 
 
 
442 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.8 
 
 
446 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.94 
 
 
282 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  34.52 
 
 
283 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  35.59 
 
 
444 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  34.59 
 
 
473 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  34.25 
 
 
271 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.49 
 
 
271 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  35.78 
 
 
463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  32.52 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.11 
 
 
271 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  30.7 
 
 
278 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.93 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  33.43 
 
 
391 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.11 
 
 
271 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.03 
 
 
271 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.48 
 
 
395 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  34.48 
 
 
352 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.37 
 
 
283 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.23 
 
 
278 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  37.5 
 
 
325 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.46 
 
 
341 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.46 
 
 
341 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  36.11 
 
 
351 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.49 
 
 
454 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.77 
 
 
405 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.51 
 
 
350 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.42 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.53 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 
378 aa  155  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.41 
 
 
379 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.93 
 
 
328 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  31.46 
 
 
396 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  28.73 
 
 
385 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  34.49 
 
 
351 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3815  resC protein  28.73 
 
 
385 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000474792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  28.73 
 
 
385 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  28.73 
 
 
385 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  29.01 
 
 
385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  29.01 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  29.01 
 
 
385 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  31.15 
 
 
396 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.16 
 
 
349 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  28.45 
 
 
385 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  31.15 
 
 
396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  31.15 
 
 
408 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  28.45 
 
 
385 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.56 
 
 
396 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  31.15 
 
 
396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  31.15 
 
 
396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  31.15 
 
 
396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 
385 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 
396 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.56 
 
 
396 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  28.18 
 
 
385 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 
396 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 
396 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 
396 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  30.69 
 
 
329 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  30.74 
 
 
403 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.63 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.56 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.46 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  31 
 
 
396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.42 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  32 
 
 
397 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.57 
 
 
397 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.85 
 
 
339 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  33.33 
 
 
304 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.08 
 
 
330 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  29.84 
 
 
395 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.15 
 
 
390 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.1 
 
 
346 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  33.7 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  33.7 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.92 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  29.7 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  30.59 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.9 
 
 
361 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  34.07 
 
 
309 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.33 
 
 
309 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.97 
 
 
340 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  33.09 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.6 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  33.09 
 
 
309 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>