49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0095 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
400 aa  819  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.89385e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  66.42 
 
 
399 aa  536  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  2.57427e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  48.9 
 
 
405 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  48.9 
 
 
405 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  48.66 
 
 
405 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  48.76 
 
 
404 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  46.94 
 
 
403 aa  362  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  46.25 
 
 
399 aa  359  5e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  47.47 
 
 
400 aa  358  6e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  45.69 
 
 
406 aa  357  2e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  46.5 
 
 
402 aa  354  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  46.31 
 
 
403 aa  352  5e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  45.3 
 
 
402 aa  350  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.234507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  48.9 
 
 
404 aa  350  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  43 
 
 
400 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  47.78 
 
 
408 aa  345  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  42.5 
 
 
400 aa  344  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  42.75 
 
 
401 aa  343  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  46.5 
 
 
402 aa  340  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  41.5 
 
 
400 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  46.24 
 
 
398 aa  340  3e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  43.8 
 
 
400 aa  338  1e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  43.73 
 
 
405 aa  335  6e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  45.38 
 
 
398 aa  332  6e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  45.43 
 
 
401 aa  332  8e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  42.25 
 
 
401 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  46.96 
 
 
405 aa  330  3e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  41.5 
 
 
400 aa  329  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  45.38 
 
 
404 aa  327  2e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  42.22 
 
 
401 aa  326  4e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  48.1 
 
 
404 aa  326  4e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  43.64 
 
 
404 aa  326  4e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  41.35 
 
 
410 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  41.56 
 
 
400 aa  306  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  44.03 
 
 
460 aa  305  9e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  43.94 
 
 
400 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.19809e-07  hitchhiker  1.87217e-15 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  43.63 
 
 
400 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  42.9 
 
 
401 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  43.06 
 
 
401 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  43.2 
 
 
404 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
403 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  42.74 
 
 
400 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  40.94 
 
 
394 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  42.3 
 
 
394 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  42.3 
 
 
394 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  42.74 
 
 
401 aa  289  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  42.94 
 
 
364 aa  265  9e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  30.91 
 
 
408 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  47.06 
 
 
96 aa  52.8  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>