More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0090 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 
454 aa  242  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  42.06 
 
 
464 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  43.65 
 
 
256 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.05 
 
 
255 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.25 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.25 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.25 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.25 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.86 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
256 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.25 
 
 
255 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.86 
 
 
255 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.46 
 
 
255 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.46 
 
 
255 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.06 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.69 
 
 
606 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.32 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
264 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.1 
 
 
462 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.94 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
462 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.45 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 
253 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 
260 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 
256 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
257 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
257 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
255 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 
256 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
260 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 
256 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  40.87 
 
 
258 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.43 
 
 
260 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
258 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.94 
 
 
256 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.55 
 
 
263 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 
259 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40 
 
 
255 aa  188  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  38.49 
 
 
255 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40 
 
 
255 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.65 
 
 
255 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 
457 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
254 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35 
 
 
458 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35 
 
 
458 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.71 
 
 
256 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
260 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  40 
 
 
256 aa  185  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  36.11 
 
 
256 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.29 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  36.96 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  36.84 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.74 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  37.88 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.98 
 
 
255 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
260 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  37.16 
 
 
260 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.35 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.16 
 
 
459 aa  181  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  38.52 
 
 
257 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  36.58 
 
 
260 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  38.67 
 
 
258 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.65 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 
257 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 
254 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
262 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  35.2 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  37.35 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  34.23 
 
 
270 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.16 
 
 
258 aa  178  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.29 
 
 
261 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
262 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.33 
 
 
256 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.19 
 
 
258 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.19 
 
 
258 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  39.21 
 
 
228 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  37.12 
 
 
276 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  37.64 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  37.64 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  37.64 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 
262 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  35.18 
 
 
266 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  37.64 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  37.26 
 
 
265 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  36.19 
 
 
258 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  38.13 
 
 
262 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  38.15 
 
 
271 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.61 
 
 
256 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  37.26 
 
 
265 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 
263 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  36.54 
 
 
258 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>