More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0087 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 576 aa  1166    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 		 607 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.11 
 
 		 607 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 		 607 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  32.38 
 
 		 613 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 624 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.34 
 
 		 685 aa  329  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  32.94 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 		 591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 625 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  33.45 
 
 		 612 aa  326  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  32.54 
 
 		 641 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  33 
 
 		 610 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 		 615 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.06 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  32.55 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  32.55 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 593 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 613 aa  316  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 		 594 aa  312  9e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  32.13 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  32.51 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 620 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  32.44 
 
 		 612 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  35.84 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  33.71 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  32.67 
 
 		 607 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 599 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 		 517 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 607 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 519 aa  306  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 594 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  32.45 
 
 		 622 aa  306  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  32.5 
 
 		 606 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 613 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  33.62 
 
 		 594 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  31.8 
 
 		 609 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 520 aa  302  9e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  30.67 
 
 		 657 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  31.26 
 
 		 657 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.8 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 626 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  32.58 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  32.94 
 
 		 607 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  32.57 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 595 aa  299  8e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  34.45 
 
 		 613 aa  299  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  33.45 
 
 		 594 aa  299  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  30.68 
 
 		 689 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  31.04 
 
 		 654 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 593 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.34 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  32.41 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  30.54 
 
 		 605 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  31.85 
 
 		 618 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  31.71 
 
 		 608 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  32.01 
 
 		 618 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  31.15 
 
 		 603 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  32.02 
 
 		 611 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 609 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  30.05 
 
 		 653 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  31.76 
 
 		 609 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  33.05 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  28.99 
 
 		 611 aa  293  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  31.97 
 
 		 609 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  33.67 
 
 		 619 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  29.93 
 
 		 613 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  33.05 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 		 609 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  30.9 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  30.86 
 
 		 626 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  30.56 
 
 		 618 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  31.2 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  31.24 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  31.21 
 
 		 617 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 604 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  31.52 
 
 		 604 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>