240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0086 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
512 aa  1006    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  26.77 
 
 
611 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  33.23 
 
 
563 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  33.23 
 
 
563 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.94 
 
 
556 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  27.94 
 
 
556 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
553 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.29 
 
 
528 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
554 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  31.89 
 
 
515 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.83 
 
 
575 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  33.44 
 
 
516 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
557 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  26.64 
 
 
553 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.86 
 
 
525 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  30.12 
 
 
514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  31.5 
 
 
515 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  29.32 
 
 
622 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
514 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  29.32 
 
 
622 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 
519 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  30.4 
 
 
605 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  31.87 
 
 
323 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  29.78 
 
 
606 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
666 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
558 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  28.85 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.38 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.2 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  26.74 
 
 
585 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  27.03 
 
 
578 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
564 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.02 
 
 
520 aa  133  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.45 
 
 
612 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  28.29 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  28.29 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  26.84 
 
 
612 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  26.91 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
558 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  29.2 
 
 
609 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
547 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  26.78 
 
 
556 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
558 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
631 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
558 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
558 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  28.24 
 
 
534 aa  123  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.51 
 
 
575 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  28.23 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
568 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  26.58 
 
 
556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
601 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.17 
 
 
568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.5 
 
 
601 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  28.82 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  27.58 
 
 
601 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 
573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
479 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.22 
 
 
553 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  28.27 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
613 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 
554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  24.3 
 
 
541 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 
584 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
556 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  27.66 
 
 
549 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.18 
 
 
583 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
564 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.77 
 
 
555 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
534 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  27.69 
 
 
613 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  24.94 
 
 
551 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  24.61 
 
 
565 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  23.8 
 
 
580 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
476 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  24.23 
 
 
536 aa  99.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  28.16 
 
 
530 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  28.16 
 
 
530 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
570 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  26.22 
 
 
604 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  26.24 
 
 
599 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.02 
 
 
550 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  28.02 
 
 
550 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.02 
 
 
550 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  28.02 
 
 
550 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
582 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.1 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.91 
 
 
550 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>