33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0076 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0076  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.568752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 732 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 		 732 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 513 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.14 
 
 		 708 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  36.47 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  36.47 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  40 
 
 		 479 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 752 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1096  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 730 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 731 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 732 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 649 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  38.6 
 
 		 394 aa  42.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.95 
 
 		 706 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 		 705 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 729 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0298102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 731 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 730 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 729 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  34.18 
 
 		 644 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  34.67 
 
 		 355 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 729 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1467  sensor protein  38.18 
 
 		 537 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.186539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 729 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 755 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.04 
 
 		 695 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1225  histidine kinase  27.36 
 
 		 423 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  36.07 
 
 		 300 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1740  sensor histidine kinase, N-terminus  35.71 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 375 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 640 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>