21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0075 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0075  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  331  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  30.23 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  30.23 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  33.59 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  31.76 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1045  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.362195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  23.81 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  28.97 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  23.53 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0715  hypothetical protein  27.91 
 
 
146 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  22.14 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  22.14 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  23.94 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  23.94 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  22.14 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  22.14 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  23.94 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  23.94 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  22.14 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  22.14 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>