More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0068 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
368 aa  722    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 
373 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  42.2 
 
 
376 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
379 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 
372 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
378 aa  275  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
370 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  41.33 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.15 
 
 
373 aa  273  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.78 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
373 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 
376 aa  268  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.9 
 
 
376 aa  268  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
374 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  42.31 
 
 
377 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  40.97 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  40.59 
 
 
384 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  41.42 
 
 
372 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
379 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.39 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  39.89 
 
 
378 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  37.1 
 
 
395 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  39.68 
 
 
390 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  38.17 
 
 
380 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  38.98 
 
 
393 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  42.47 
 
 
371 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  41.91 
 
 
373 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
373 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
368 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
373 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0643  gamma-glutamyl kinase  39.61 
 
 
351 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.48 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  39.89 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 
376 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0618  gamma-glutamyl kinase  39.06 
 
 
351 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  39.57 
 
 
375 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  39.78 
 
 
367 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  39.08 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  40 
 
 
369 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  37.53 
 
 
376 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  40.53 
 
 
374 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  38.5 
 
 
376 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  44.16 
 
 
343 aa  249  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  39.29 
 
 
367 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  39.62 
 
 
369 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  38.17 
 
 
389 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  39.45 
 
 
367 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  38.38 
 
 
372 aa  249  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
375 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  38.44 
 
 
389 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  43.55 
 
 
388 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
375 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 
393 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  39.01 
 
 
367 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  39.62 
 
 
376 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  39.01 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  38.83 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  39.57 
 
 
371 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  38.8 
 
 
414 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  38.74 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  39.3 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  38.27 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  36.97 
 
 
378 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  37.1 
 
 
393 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  36.36 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  38.27 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  37.17 
 
 
390 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  39.35 
 
 
381 aa  242  6e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  39.45 
 
 
392 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 
374 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  37.43 
 
 
374 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
367 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 
374 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  39.02 
 
 
372 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  38.71 
 
 
372 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  39.14 
 
 
373 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  38.3 
 
 
369 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  38.59 
 
 
367 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  39.68 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>