74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0057 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  42 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0446  hypothetical protein  39.13 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1353  general glycosylation pathway protein  39.68 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1201  general glycosylation pathway protein  39.68 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  39.69 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  33.94 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  36.12 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  39.26 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  35.04 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0948  general glycosylation pathway protein  39.46 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  35.43 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  35.43 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  34.98 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1457  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  32.45 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.132022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  40.74 
 
 		 90 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3301  pyruvate carboxyltransferase  34.62 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0419  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.092236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  29.73 
 
 		 155 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1549  pyruvate carboxyltransferase  31.31 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2536  pyruvate carboxyltransferase  29.91 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0520244  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0520  HMGL-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.88 
 
 		 806 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  33.33 
 
 		 516 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0102  pyruvate carboxyltransferase  28.57 
 
 		 611 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0074  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  0.959579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.13 
 
 		 416 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 451 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 579 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00664797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1124  hypothetical protein  23.4 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.414732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2092  pyruvate carboxyltransferase  26.55 
 
 		 620 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  33.85 
 
 		 665 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  36.36 
 
 		 885 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.08 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  26.21 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 498 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.332508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 698 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.61 
 
 		 609 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.61 
 
 		 608 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  28.3 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  28.3 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  32.2 
 
 		 629 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  28.3 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  32.2 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  25.47 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  35.16 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0166  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.604239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  30.63 
 
 		 666 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.77 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  29.73 
 
 		 666 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.36 
 
 		 677 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  28.3 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2013  hypothetical protein  26.8 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.19 
 
 		 630 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  29.47 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  27.27 
 
 		 666 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  29.47 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.97 
 
 		 630 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  27.27 
 
 		 666 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.59 
 
 		 690 aa  42.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>