More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0033 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  40.82 
 
 
155 aa  89  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  44.9 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  33.57 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  40.74 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  40.46 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  41.51 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  43.4 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.1 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.1 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  40.95 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  38.69 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.74 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.28 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.28 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.28 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.28 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.23 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.81 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  34.53 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40.57 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  37.37 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.05 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.5 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  43.12 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.72 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  38.6 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  35.34 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  30.37 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.45 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  43.69 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  35.33 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  32.06 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.94 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  35.04 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.14 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  37.23 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.95 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  37.3 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0186  hypothetical protein  37.38 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  31.11 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.8 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  39.42 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  32.76 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  32.38 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.16 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  32.85 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.95 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  39.62 
 
 
169 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  42.45 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  33.96 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  36.79 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0117  protein of unknown function UPF0079  33.6 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  30.37 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  31.09 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1712  hypothetical protein  35.04 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.42 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  38.95 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  31.71 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.42 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  32.38 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  31.71 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.64 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.42 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  36.79 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  38.95 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  32.35 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  38.95 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  35.51 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  36.04 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  31.78 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  37.89 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  37.89 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  37.89 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  37.89 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  33.68 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  28.24 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>