More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0032 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  596  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 290 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  318  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  51.7 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 		 292 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 298 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 298 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  51.02 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  52.61 
 
 		 292 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 288 aa  298  7e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  52.71 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 292 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  48.48 
 
 		 300 aa  295  7e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 297 aa  295  9e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 294 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 289 aa  288  7e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 292 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  288  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  51.41 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 301 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>